Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B4

SMYD3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3Q9H7B4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms