Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6R3

ACSS3, Acyl-CoA synthetase short-chain family member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS3Q9H6R3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACSS3Q9H6R3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACSS3Q9H6R3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACSS3Q9H6R3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACSS3Q9H6R3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACSS3Q9H6R3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACSS3Q9H6R3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACSS3Q9H6R3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACSS3Q9H6R3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACSS3Q9H6R3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACSS3Q9H6R3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACSS3Q9H6R3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACSS3Q9H6R3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACSS3Q9H6R3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACSS3Q9H6R3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACSS3Q9H6R3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACSS3Q9H6R3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACSS3Q9H6R3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACSS3Q9H6R3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACSS3Q9H6R3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACSS3Q9H6R3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACSS3Q9H6R3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACSS3Q9H6R3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACSS3Q9H6R3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACSS3Q9H6R3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACSS3Q9H6R3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACSS3Q9H6R3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACSS3Q9H6R3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACSS3Q9H6R3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 251.5 ms