Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4W6

EBF3, Transcription factor COE3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF3Q9H4W6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms