Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC8Q9H0W5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC8Q9H0W5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC8Q9H0W5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC8Q9H0W5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC8Q9H0W5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC8Q9H0W5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC8Q9H0W5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC8Q9H0W5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC8Q9H0W5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC8Q9H0W5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC8Q9H0W5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC8Q9H0W5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC8Q9H0W5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC8Q9H0W5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC8Q9H0W5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC8Q9H0W5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC8Q9H0W5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC8Q9H0W5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC8Q9H0W5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC8Q9H0W5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC8Q9H0W5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC8Q9H0W5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC8Q9H0W5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC8Q9H0W5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC8Q9H0W5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC8Q9H0W5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC8Q9H0W5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC8Q9H0W5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC8Q9H0W5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC8Q9H0W5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC8Q9H0W5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC8Q9H0W5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms