Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0K1

SIK2, Serine/threonine-protein kinase SIK2, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK2Q9H0K1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SIK2Q9H0K1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms