Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms