Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms