Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
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