Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZC3H12CQ9C0D7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZC3H12CQ9C0D7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZC3H12CQ9C0D7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZC3H12CQ9C0D7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ZC3H12CQ9C0D7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZC3H12CQ9C0D7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZC3H12CQ9C0D7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZC3H12CQ9C0D7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZC3H12CQ9C0D7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZC3H12CQ9C0D7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZC3H12CQ9C0D7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZC3H12CQ9C0D7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZC3H12CQ9C0D7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ZC3H12CQ9C0D7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ZC3H12CQ9C0D7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZC3H12CQ9C0D7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZC3H12CQ9C0D7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZC3H12CQ9C0D7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZC3H12CQ9C0D7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZC3H12CQ9C0D7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZC3H12CQ9C0D7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZC3H12CQ9C0D7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ZC3H12CQ9C0D7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZC3H12CQ9C0D7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZC3H12CQ9C0D7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZC3H12CQ9C0D7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZC3H12CQ9C0D7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZC3H12CQ9C0D7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZC3H12CQ9C0D7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZC3H12CQ9C0D7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ZC3H12CQ9C0D7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZC3H12CQ9C0D7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZC3H12CQ9C0D7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZC3H12CQ9C0D7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZC3H12CQ9C0D7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZC3H12CQ9C0D7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZC3H12CQ9C0D7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZC3H12CQ9C0D7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZC3H12CQ9C0D7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZC3H12CQ9C0D7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZC3H12CQ9C0D7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ZC3H12CQ9C0D7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZC3H12CQ9C0D7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZC3H12CQ9C0D7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZC3H12CQ9C0D7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZC3H12CQ9C0D7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZC3H12CQ9C0D7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZC3H12CQ9C0D7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZC3H12CQ9C0D7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZC3H12CQ9C0D7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZC3H12CQ9C0D7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZC3H12CQ9C0D7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZC3H12CQ9C0D7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZC3H12CQ9C0D7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms