Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
UBE2OQ9C0C9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE2OQ9C0C9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE2OQ9C0C9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE2OQ9C0C9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE2OQ9C0C9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE2OQ9C0C9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE2OQ9C0C9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE2OQ9C0C9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE2OQ9C0C9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE2OQ9C0C9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE2OQ9C0C9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE2OQ9C0C9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE2OQ9C0C9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE2OQ9C0C9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE2OQ9C0C9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE2OQ9C0C9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE2OQ9C0C9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE2OQ9C0C9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE2OQ9C0C9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE2OQ9C0C9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE2OQ9C0C9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE2OQ9C0C9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE2OQ9C0C9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE2OQ9C0C9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE2OQ9C0C9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE2OQ9C0C9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE2OQ9C0C9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE2OQ9C0C9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE2OQ9C0C9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE2OQ9C0C9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE2OQ9C0C9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE2OQ9C0C9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE2OQ9C0C9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE2OQ9C0C9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE2OQ9C0C9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms