Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AMBRA1Q9C0C7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms