Protein–RNA interactions for Protein: Q9C029

TRIM7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM7Q9C029 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM7Q9C029 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM7Q9C029 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms