Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD9

ACTRT3, Actin-related protein T3, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT3Q9BYD9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTRT3Q9BYD9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTRT3Q9BYD9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTRT3Q9BYD9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTRT3Q9BYD9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTRT3Q9BYD9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTRT3Q9BYD9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTRT3Q9BYD9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTRT3Q9BYD9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTRT3Q9BYD9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTRT3Q9BYD9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTRT3Q9BYD9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTRT3Q9BYD9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTRT3Q9BYD9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTRT3Q9BYD9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTRT3Q9BYD9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTRT3Q9BYD9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTRT3Q9BYD9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTRT3Q9BYD9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTRT3Q9BYD9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTRT3Q9BYD9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTRT3Q9BYD9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTRT3Q9BYD9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTRT3Q9BYD9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTRT3Q9BYD9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTRT3Q9BYD9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTRT3Q9BYD9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTRT3Q9BYD9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTRT3Q9BYD9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTRT3Q9BYD9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTRT3Q9BYD9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTRT3Q9BYD9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTRT3Q9BYD9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTRT3Q9BYD9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTRT3Q9BYD9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTRT3Q9BYD9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTRT3Q9BYD9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms