Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNHG12Q9BXW3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms