Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLVAPQ9BX97 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLVAPQ9BX97 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms