Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
BRIP1Q9BX63 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRIP1Q9BX63 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRIP1Q9BX63 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRIP1Q9BX63 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRIP1Q9BX63 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRIP1Q9BX63 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRIP1Q9BX63 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRIP1Q9BX63 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRIP1Q9BX63 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRIP1Q9BX63 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRIP1Q9BX63 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRIP1Q9BX63 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRIP1Q9BX63 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRIP1Q9BX63 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRIP1Q9BX63 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRIP1Q9BX63 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRIP1Q9BX63 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRIP1Q9BX63 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
BRIP1Q9BX63 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRIP1Q9BX63 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRIP1Q9BX63 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
BRIP1Q9BX63 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRIP1Q9BX63 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
BRIP1Q9BX63 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRIP1Q9BX63 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRIP1Q9BX63 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRIP1Q9BX63 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRIP1Q9BX63 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRIP1Q9BX63 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRIP1Q9BX63 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRIP1Q9BX63 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRIP1Q9BX63 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRIP1Q9BX63 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRIP1Q9BX63 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
BRIP1Q9BX63 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
BRIP1Q9BX63 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
BRIP1Q9BX63 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRIP1Q9BX63 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRIP1Q9BX63 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRIP1Q9BX63 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRIP1Q9BX63 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRIP1Q9BX63 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRIP1Q9BX63 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRIP1Q9BX63 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRIP1Q9BX63 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRIP1Q9BX63 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRIP1Q9BX63 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRIP1Q9BX63 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRIP1Q9BX63 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRIP1Q9BX63 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRIP1Q9BX63 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRIP1Q9BX63 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRIP1Q9BX63 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRIP1Q9BX63 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRIP1Q9BX63 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRIP1Q9BX63 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRIP1Q9BX63 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRIP1Q9BX63 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRIP1Q9BX63 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRIP1Q9BX63 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRIP1Q9BX63 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRIP1Q9BX63 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRIP1Q9BX63 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRIP1Q9BX63 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRIP1Q9BX63 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRIP1Q9BX63 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRIP1Q9BX63 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRIP1Q9BX63 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRIP1Q9BX63 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRIP1Q9BX63 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRIP1Q9BX63 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRIP1Q9BX63 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
BRIP1Q9BX63 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRIP1Q9BX63 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRIP1Q9BX63 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRIP1Q9BX63 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRIP1Q9BX63 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRIP1Q9BX63 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRIP1Q9BX63 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRIP1Q9BX63 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRIP1Q9BX63 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRIP1Q9BX63 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRIP1Q9BX63 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRIP1Q9BX63 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
BRIP1Q9BX63 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRIP1Q9BX63 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRIP1Q9BX63 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRIP1Q9BX63 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRIP1Q9BX63 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms