Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SYCP2Q9BX26 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SYCP2Q9BX26 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SYCP2Q9BX26 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SYCP2Q9BX26 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SYCP2Q9BX26 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SYCP2Q9BX26 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SYCP2Q9BX26 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SYCP2Q9BX26 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
SYCP2Q9BX26 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SYCP2Q9BX26 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SYCP2Q9BX26 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SYCP2Q9BX26 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
SYCP2Q9BX26 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SYCP2Q9BX26 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SYCP2Q9BX26 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
SYCP2Q9BX26 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
SYCP2Q9BX26 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SYCP2Q9BX26 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SYCP2Q9BX26 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SYCP2Q9BX26 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
SYCP2Q9BX26 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SYCP2Q9BX26 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SYCP2Q9BX26 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SYCP2Q9BX26 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
SYCP2Q9BX26 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SYCP2Q9BX26 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SYCP2Q9BX26 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SYCP2Q9BX26 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
SYCP2Q9BX26 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SYCP2Q9BX26 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SYCP2Q9BX26 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SYCP2Q9BX26 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SYCP2Q9BX26 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SYCP2Q9BX26 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SYCP2Q9BX26 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SYCP2Q9BX26 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SYCP2Q9BX26 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SYCP2Q9BX26 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SYCP2Q9BX26 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SYCP2Q9BX26 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SYCP2Q9BX26 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SYCP2Q9BX26 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SYCP2Q9BX26 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SYCP2Q9BX26 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SYCP2Q9BX26 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SYCP2Q9BX26 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SYCP2Q9BX26 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SYCP2Q9BX26 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SYCP2Q9BX26 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SYCP2Q9BX26 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SYCP2Q9BX26 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SYCP2Q9BX26 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SYCP2Q9BX26 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SYCP2Q9BX26 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SYCP2Q9BX26 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SYCP2Q9BX26 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SYCP2Q9BX26 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SYCP2Q9BX26 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
SYCP2Q9BX26 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SYCP2Q9BX26 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SYCP2Q9BX26 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
SYCP2Q9BX26 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SYCP2Q9BX26 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SYCP2Q9BX26 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SYCP2Q9BX26 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SYCP2Q9BX26 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SYCP2Q9BX26 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SYCP2Q9BX26 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SYCP2Q9BX26 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SYCP2Q9BX26 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SYCP2Q9BX26 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SYCP2Q9BX26 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SYCP2Q9BX26 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SYCP2Q9BX26 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SYCP2Q9BX26 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SYCP2Q9BX26 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SYCP2Q9BX26 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SYCP2Q9BX26 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SYCP2Q9BX26 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SYCP2Q9BX26 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SYCP2Q9BX26 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SYCP2Q9BX26 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SYCP2Q9BX26 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SYCP2Q9BX26 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SYCP2Q9BX26 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SYCP2Q9BX26 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SYCP2Q9BX26 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SYCP2Q9BX26 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SYCP2Q9BX26 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SYCP2Q9BX26 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SYCP2Q9BX26 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SYCP2Q9BX26 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SYCP2Q9BX26 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SYCP2Q9BX26 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SYCP2Q9BX26 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SYCP2Q9BX26 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SYCP2Q9BX26 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SYCP2Q9BX26 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
SYCP2Q9BX26 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms