Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX1

PHF7, PHD finger protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF7Q9BWX1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF7Q9BWX1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF7Q9BWX1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF7Q9BWX1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms