Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB2BQ9BVA1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB2BQ9BVA1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB2BQ9BVA1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBB2BQ9BVA1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBB2BQ9BVA1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBB2BQ9BVA1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBB2BQ9BVA1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBB2BQ9BVA1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBB2BQ9BVA1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBB2BQ9BVA1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBB2BQ9BVA1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBB2BQ9BVA1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBB2BQ9BVA1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBB2BQ9BVA1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBB2BQ9BVA1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBB2BQ9BVA1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB2BQ9BVA1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB2BQ9BVA1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB2BQ9BVA1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB2BQ9BVA1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB2BQ9BVA1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB2BQ9BVA1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB2BQ9BVA1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB2BQ9BVA1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB2BQ9BVA1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBB2BQ9BVA1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBB2BQ9BVA1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBB2BQ9BVA1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBB2BQ9BVA1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBB2BQ9BVA1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBB2BQ9BVA1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBB2BQ9BVA1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBB2BQ9BVA1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB2BQ9BVA1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms