Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms