Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM208Q9BTX3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM208Q9BTX3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM208Q9BTX3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM208Q9BTX3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM208Q9BTX3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM208Q9BTX3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM208Q9BTX3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM208Q9BTX3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM208Q9BTX3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM208Q9BTX3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM208Q9BTX3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM208Q9BTX3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM208Q9BTX3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM208Q9BTX3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM208Q9BTX3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM208Q9BTX3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM208Q9BTX3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM208Q9BTX3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM208Q9BTX3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM208Q9BTX3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM208Q9BTX3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM208Q9BTX3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM208Q9BTX3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM208Q9BTX3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM208Q9BTX3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM208Q9BTX3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM208Q9BTX3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM208Q9BTX3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM208Q9BTX3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM208Q9BTX3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM208Q9BTX3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM208Q9BTX3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM208Q9BTX3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM208Q9BTX3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM208Q9BTX3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM208Q9BTX3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms