Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
UPK3BQ9BT76 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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UPK3BQ9BT76 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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UPK3BQ9BT76 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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UPK3BQ9BT76 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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UPK3BQ9BT76 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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UPK3BQ9BT76 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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UPK3BQ9BT76 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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