Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RIOK1Q9BRS2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RIOK1Q9BRS2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RIOK1Q9BRS2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RIOK1Q9BRS2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RIOK1Q9BRS2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RIOK1Q9BRS2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RIOK1Q9BRS2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RIOK1Q9BRS2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RIOK1Q9BRS2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RIOK1Q9BRS2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RIOK1Q9BRS2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RIOK1Q9BRS2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RIOK1Q9BRS2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RIOK1Q9BRS2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RIOK1Q9BRS2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RIOK1Q9BRS2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RIOK1Q9BRS2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RIOK1Q9BRS2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RIOK1Q9BRS2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RIOK1Q9BRS2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RIOK1Q9BRS2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RIOK1Q9BRS2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RIOK1Q9BRS2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RIOK1Q9BRS2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RIOK1Q9BRS2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RIOK1Q9BRS2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RIOK1Q9BRS2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RIOK1Q9BRS2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RIOK1Q9BRS2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RIOK1Q9BRS2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RIOK1Q9BRS2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIOK1Q9BRS2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIOK1Q9BRS2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIOK1Q9BRS2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIOK1Q9BRS2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RIOK1Q9BRS2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIOK1Q9BRS2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIOK1Q9BRS2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIOK1Q9BRS2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIOK1Q9BRS2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIOK1Q9BRS2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIOK1Q9BRS2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RIOK1Q9BRS2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RIOK1Q9BRS2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RIOK1Q9BRS2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RIOK1Q9BRS2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RIOK1Q9BRS2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RIOK1Q9BRS2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RIOK1Q9BRS2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RIOK1Q9BRS2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RIOK1Q9BRS2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RIOK1Q9BRS2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RIOK1Q9BRS2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RIOK1Q9BRS2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RIOK1Q9BRS2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RIOK1Q9BRS2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RIOK1Q9BRS2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RIOK1Q9BRS2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RIOK1Q9BRS2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RIOK1Q9BRS2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RIOK1Q9BRS2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RIOK1Q9BRS2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms