Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP4

PAAF1, Proteasomal ATPase-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAAF1Q9BRP4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAAF1Q9BRP4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAAF1Q9BRP4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms