Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TREX2Q9BQ50 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms