Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms