Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DUSP9Q99956 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms