Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MYD88Q99836 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MYD88Q99836 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MYD88Q99836 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MYD88Q99836 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MYD88Q99836 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MYD88Q99836 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MYD88Q99836 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MYD88Q99836 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MYD88Q99836 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MYD88Q99836 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MYD88Q99836 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MYD88Q99836 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MYD88Q99836 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MYD88Q99836 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
MYD88Q99836 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYD88Q99836 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYD88Q99836 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYD88Q99836 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYD88Q99836 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYD88Q99836 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
MYD88Q99836 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYD88Q99836 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYD88Q99836 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYD88Q99836 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYD88Q99836 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYD88Q99836 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYD88Q99836 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYD88Q99836 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYD88Q99836 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYD88Q99836 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYD88Q99836 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYD88Q99836 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
MYD88Q99836 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYD88Q99836 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYD88Q99836 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYD88Q99836 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYD88Q99836 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MYD88Q99836 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MYD88Q99836 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MYD88Q99836 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MYD88Q99836 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
MYD88Q99836 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MYD88Q99836 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MYD88Q99836 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MYD88Q99836 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MYD88Q99836 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MYD88Q99836 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MYD88Q99836 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MYD88Q99836 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MYD88Q99836 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
MYD88Q99836 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
MYD88Q99836 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
MYD88Q99836 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
MYD88Q99836 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MYD88Q99836 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MYD88Q99836 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MYD88Q99836 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MYD88Q99836 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MYD88Q99836 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MYD88Q99836 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYD88Q99836 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYD88Q99836 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYD88Q99836 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYD88Q99836 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYD88Q99836 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYD88Q99836 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYD88Q99836 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYD88Q99836 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYD88Q99836 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYD88Q99836 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
MYD88Q99836 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYD88Q99836 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYD88Q99836 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYD88Q99836 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYD88Q99836 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYD88Q99836 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYD88Q99836 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYD88Q99836 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYD88Q99836 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYD88Q99836 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYD88Q99836 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYD88Q99836 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MYD88Q99836 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MYD88Q99836 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MYD88Q99836 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MYD88Q99836 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MYD88Q99836 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
MYD88Q99836 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
MYD88Q99836 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MYD88Q99836 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MYD88Q99836 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MYD88Q99836 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MYD88Q99836 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MYD88Q99836 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MYD88Q99836 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MYD88Q99836 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYD88Q99836 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYD88Q99836 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYD88Q99836 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms