Protein–RNA interactions for Protein: Q99618

CDCA3, Cell division cycle-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3Q99618 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA3Q99618 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA3Q99618 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms