Protein–RNA interactions for Protein: Q99607

ELF4, ETS-related transcription factor Elf-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF4Q99607 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ELF4Q99607 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ELF4Q99607 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ELF4Q99607 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ELF4Q99607 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ELF4Q99607 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ELF4Q99607 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ELF4Q99607 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ELF4Q99607 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ELF4Q99607 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms