Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms