Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CRBNQ96SW2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CRBNQ96SW2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CRBNQ96SW2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CRBNQ96SW2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CRBNQ96SW2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CRBNQ96SW2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CRBNQ96SW2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CRBNQ96SW2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CRBNQ96SW2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CRBNQ96SW2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CRBNQ96SW2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CRBNQ96SW2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CRBNQ96SW2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CRBNQ96SW2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CRBNQ96SW2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CRBNQ96SW2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CRBNQ96SW2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CRBNQ96SW2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CRBNQ96SW2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CRBNQ96SW2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRBNQ96SW2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRBNQ96SW2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRBNQ96SW2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRBNQ96SW2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRBNQ96SW2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRBNQ96SW2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRBNQ96SW2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRBNQ96SW2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms