Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB4

SRPK1, SRSF protein kinase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK1Q96SB4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms