Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CSRNP1Q96S65 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CSRNP1Q96S65 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSRNP1Q96S65 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CSRNP1Q96S65 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSRNP1Q96S65 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSRNP1Q96S65 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CSRNP1Q96S65 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSRNP1Q96S65 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSRNP1Q96S65 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CSRNP1Q96S65 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CSRNP1Q96S65 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CSRNP1Q96S65 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CSRNP1Q96S65 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CSRNP1Q96S65 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CSRNP1Q96S65 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CSRNP1Q96S65 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CSRNP1Q96S65 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CSRNP1Q96S65 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CSRNP1Q96S65 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CSRNP1Q96S65 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CSRNP1Q96S65 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CSRNP1Q96S65 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSRNP1Q96S65 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSRNP1Q96S65 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CSRNP1Q96S65 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSRNP1Q96S65 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSRNP1Q96S65 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CSRNP1Q96S65 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSRNP1Q96S65 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSRNP1Q96S65 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSRNP1Q96S65 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSRNP1Q96S65 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSRNP1Q96S65 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSRNP1Q96S65 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSRNP1Q96S65 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSRNP1Q96S65 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSRNP1Q96S65 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSRNP1Q96S65 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSRNP1Q96S65 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSRNP1Q96S65 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSRNP1Q96S65 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSRNP1Q96S65 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSRNP1Q96S65 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSRNP1Q96S65 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSRNP1Q96S65 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSRNP1Q96S65 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSRNP1Q96S65 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSRNP1Q96S65 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSRNP1Q96S65 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSRNP1Q96S65 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSRNP1Q96S65 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSRNP1Q96S65 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSRNP1Q96S65 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSRNP1Q96S65 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CSRNP1Q96S65 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CSRNP1Q96S65 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CSRNP1Q96S65 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CSRNP1Q96S65 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CSRNP1Q96S65 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CSRNP1Q96S65 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CSRNP1Q96S65 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CSRNP1Q96S65 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms