Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SLC4A9Q96Q91 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SLC4A9Q96Q91 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC4A9Q96Q91 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC4A9Q96Q91 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC4A9Q96Q91 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC4A9Q96Q91 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC4A9Q96Q91 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC4A9Q96Q91 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC4A9Q96Q91 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC4A9Q96Q91 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC4A9Q96Q91 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC4A9Q96Q91 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC4A9Q96Q91 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC4A9Q96Q91 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC4A9Q96Q91 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC4A9Q96Q91 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC4A9Q96Q91 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC4A9Q96Q91 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC4A9Q96Q91 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC4A9Q96Q91 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC4A9Q96Q91 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC4A9Q96Q91 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC4A9Q96Q91 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC4A9Q96Q91 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC4A9Q96Q91 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC4A9Q96Q91 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC4A9Q96Q91 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC4A9Q96Q91 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC4A9Q96Q91 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC4A9Q96Q91 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC4A9Q96Q91 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC4A9Q96Q91 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC4A9Q96Q91 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC4A9Q96Q91 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC4A9Q96Q91 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC4A9Q96Q91 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC4A9Q96Q91 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC4A9Q96Q91 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC4A9Q96Q91 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC4A9Q96Q91 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC4A9Q96Q91 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms