Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
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