Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL1

TMEM74, Transmembrane protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM74Q96NL1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM74Q96NL1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM74Q96NL1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM74Q96NL1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM74Q96NL1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM74Q96NL1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM74Q96NL1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM74Q96NL1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM74Q96NL1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM74Q96NL1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM74Q96NL1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM74Q96NL1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM74Q96NL1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM74Q96NL1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM74Q96NL1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM74Q96NL1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM74Q96NL1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM74Q96NL1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM74Q96NL1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM74Q96NL1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM74Q96NL1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM74Q96NL1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM74Q96NL1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM74Q96NL1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM74Q96NL1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM74Q96NL1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM74Q96NL1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM74Q96NL1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM74Q96NL1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM74Q96NL1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM74Q96NL1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM74Q96NL1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM74Q96NL1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM74Q96NL1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM74Q96NL1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM74Q96NL1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM74Q96NL1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM74Q96NL1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM74Q96NL1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM74Q96NL1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM74Q96NL1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM74Q96NL1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM74Q96NL1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM74Q96NL1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM74Q96NL1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM74Q96NL1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM74Q96NL1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM74Q96NL1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM74Q96NL1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM74Q96NL1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM74Q96NL1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM74Q96NL1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM74Q96NL1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM74Q96NL1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM74Q96NL1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM74Q96NL1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM74Q96NL1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM74Q96NL1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM74Q96NL1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM74Q96NL1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM74Q96NL1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM74Q96NL1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM74Q96NL1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM74Q96NL1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM74Q96NL1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM74Q96NL1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM74Q96NL1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM74Q96NL1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM74Q96NL1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM74Q96NL1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM74Q96NL1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM74Q96NL1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM74Q96NL1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM74Q96NL1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM74Q96NL1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM74Q96NL1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM74Q96NL1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM74Q96NL1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM74Q96NL1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM74Q96NL1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM74Q96NL1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM74Q96NL1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM74Q96NL1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM74Q96NL1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM74Q96NL1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM74Q96NL1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM74Q96NL1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM74Q96NL1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM74Q96NL1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM74Q96NL1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM74Q96NL1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM74Q96NL1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM74Q96NL1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM74Q96NL1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM74Q96NL1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM74Q96NL1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM74Q96NL1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM74Q96NL1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM74Q96NL1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM74Q96NL1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms