Protein–RNA interactions for Protein: Q96N96

SPATA13, Spermatogenesis-associated protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA13Q96N96 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA13Q96N96 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA13Q96N96 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA13Q96N96 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA13Q96N96 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA13Q96N96 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA13Q96N96 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA13Q96N96 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA13Q96N96 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA13Q96N96 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA13Q96N96 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA13Q96N96 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA13Q96N96 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA13Q96N96 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA13Q96N96 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA13Q96N96 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA13Q96N96 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA13Q96N96 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA13Q96N96 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA13Q96N96 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA13Q96N96 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SPATA13Q96N96 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms