Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPNS2Q96L46 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
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