Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDLIM2Q96JY6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDLIM2Q96JY6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms