Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PGBD1Q96JS3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PGBD1Q96JS3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PGBD1Q96JS3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PGBD1Q96JS3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PGBD1Q96JS3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PGBD1Q96JS3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PGBD1Q96JS3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PGBD1Q96JS3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PGBD1Q96JS3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PGBD1Q96JS3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PGBD1Q96JS3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PGBD1Q96JS3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PGBD1Q96JS3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PGBD1Q96JS3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PGBD1Q96JS3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PGBD1Q96JS3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PGBD1Q96JS3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PGBD1Q96JS3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PGBD1Q96JS3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PGBD1Q96JS3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PGBD1Q96JS3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PGBD1Q96JS3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PGBD1Q96JS3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PGBD1Q96JS3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PGBD1Q96JS3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PGBD1Q96JS3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PGBD1Q96JS3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PGBD1Q96JS3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PGBD1Q96JS3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PGBD1Q96JS3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PGBD1Q96JS3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PGBD1Q96JS3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PGBD1Q96JS3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PGBD1Q96JS3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PGBD1Q96JS3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PGBD1Q96JS3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PGBD1Q96JS3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PGBD1Q96JS3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PGBD1Q96JS3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PGBD1Q96JS3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PGBD1Q96JS3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PGBD1Q96JS3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PGBD1Q96JS3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PGBD1Q96JS3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PGBD1Q96JS3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PGBD1Q96JS3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PGBD1Q96JS3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PGBD1Q96JS3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PGBD1Q96JS3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PGBD1Q96JS3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PGBD1Q96JS3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PGBD1Q96JS3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PGBD1Q96JS3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PGBD1Q96JS3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PGBD1Q96JS3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PGBD1Q96JS3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms