Protein–RNA interactions for Protein: Q96JP9

CDHR1, Cadherin-related family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR1Q96JP9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDHR1Q96JP9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDHR1Q96JP9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDHR1Q96JP9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDHR1Q96JP9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDHR1Q96JP9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDHR1Q96JP9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CDHR1Q96JP9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDHR1Q96JP9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDHR1Q96JP9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDHR1Q96JP9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDHR1Q96JP9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDHR1Q96JP9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDHR1Q96JP9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDHR1Q96JP9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms