Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC136Q96JN2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms