Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ7

TMX3, Protein disulfide-isomerase TMX3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3Q96JJ7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMX3Q96JJ7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMX3Q96JJ7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms