Protein–RNA interactions for Protein: Q96J84

KIRREL1, Kin of IRRE-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIRREL1Q96J84 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KIRREL1Q96J84 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms