Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms