Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCC12Q96J65 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCC12Q96J65 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCC12Q96J65 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCC12Q96J65 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCC12Q96J65 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCC12Q96J65 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCC12Q96J65 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCC12Q96J65 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCC12Q96J65 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCC12Q96J65 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCC12Q96J65 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCC12Q96J65 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCC12Q96J65 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCC12Q96J65 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCC12Q96J65 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCC12Q96J65 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCC12Q96J65 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCC12Q96J65 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCC12Q96J65 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCC12Q96J65 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCC12Q96J65 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCC12Q96J65 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCC12Q96J65 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCC12Q96J65 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCC12Q96J65 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCC12Q96J65 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCC12Q96J65 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCC12Q96J65 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCC12Q96J65 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCC12Q96J65 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCC12Q96J65 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCC12Q96J65 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCC12Q96J65 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCC12Q96J65 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCC12Q96J65 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCC12Q96J65 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCC12Q96J65 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCC12Q96J65 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCC12Q96J65 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCC12Q96J65 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ABCC12Q96J65 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ABCC12Q96J65 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ABCC12Q96J65 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCC12Q96J65 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCC12Q96J65 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCC12Q96J65 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCC12Q96J65 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCC12Q96J65 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCC12Q96J65 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCC12Q96J65 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCC12Q96J65 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCC12Q96J65 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCC12Q96J65 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCC12Q96J65 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCC12Q96J65 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCC12Q96J65 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCC12Q96J65 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCC12Q96J65 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCC12Q96J65 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCC12Q96J65 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCC12Q96J65 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCC12Q96J65 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCC12Q96J65 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCC12Q96J65 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCC12Q96J65 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCC12Q96J65 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCC12Q96J65 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCC12Q96J65 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCC12Q96J65 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCC12Q96J65 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCC12Q96J65 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCC12Q96J65 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCC12Q96J65 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCC12Q96J65 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCC12Q96J65 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCC12Q96J65 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ABCC12Q96J65 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ABCC12Q96J65 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ABCC12Q96J65 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ABCC12Q96J65 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ABCC12Q96J65 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ABCC12Q96J65 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ABCC12Q96J65 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ABCC12Q96J65 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ABCC12Q96J65 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ABCC12Q96J65 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ABCC12Q96J65 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCC12Q96J65 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCC12Q96J65 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCC12Q96J65 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCC12Q96J65 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCC12Q96J65 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCC12Q96J65 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCC12Q96J65 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCC12Q96J65 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCC12Q96J65 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCC12Q96J65 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCC12Q96J65 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCC12Q96J65 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms