Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms