Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LTV1Q96GA3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LTV1Q96GA3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LTV1Q96GA3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LTV1Q96GA3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
LTV1Q96GA3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
LTV1Q96GA3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
LTV1Q96GA3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LTV1Q96GA3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LTV1Q96GA3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LTV1Q96GA3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LTV1Q96GA3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
LTV1Q96GA3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LTV1Q96GA3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LTV1Q96GA3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
LTV1Q96GA3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LTV1Q96GA3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LTV1Q96GA3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
LTV1Q96GA3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LTV1Q96GA3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LTV1Q96GA3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LTV1Q96GA3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
LTV1Q96GA3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LTV1Q96GA3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
LTV1Q96GA3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LTV1Q96GA3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
LTV1Q96GA3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LTV1Q96GA3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LTV1Q96GA3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LTV1Q96GA3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LTV1Q96GA3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LTV1Q96GA3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LTV1Q96GA3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LTV1Q96GA3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LTV1Q96GA3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LTV1Q96GA3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LTV1Q96GA3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LTV1Q96GA3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
LTV1Q96GA3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
LTV1Q96GA3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LTV1Q96GA3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
LTV1Q96GA3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LTV1Q96GA3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LTV1Q96GA3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LTV1Q96GA3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LTV1Q96GA3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LTV1Q96GA3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LTV1Q96GA3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LTV1Q96GA3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LTV1Q96GA3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
LTV1Q96GA3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LTV1Q96GA3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LTV1Q96GA3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LTV1Q96GA3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LTV1Q96GA3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LTV1Q96GA3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LTV1Q96GA3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LTV1Q96GA3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
LTV1Q96GA3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
LTV1Q96GA3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
LTV1Q96GA3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
LTV1Q96GA3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
LTV1Q96GA3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
LTV1Q96GA3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms