Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP6

GRAMD1A, GRAM domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1AQ96CP6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms